Stratégie basée sur l’association au niveau du génome entier pour une sélection sans biais des gènes candidats associés aux maladies inflammatoires

Les personnes susceptibles d’être atteintes de maladies inflammatoires pourraient être ciblées afin de recevoir des mesures préventives ou des soins si l’on pouvait les identifier au moyen de leur code génétique. Toutefois, jusqu’à présent, il n’existe pas de méthode efficace pour découvrir lesquelles des 5 millions de variantes génétiques jouent un rôle important dans la détermination de la susceptibilité aux maladies. Une approche actuelle est de tester, chez chaque patient, chaque variation génétique afin d’en dégager la corrélation avec une maladie particulière (appelée association au niveau du génome entier ou WGA selon son acronyme anglais), mais c’est un processus extrêmement onéreux et lent. Le stagiaire se servira d’une approche différente qui consiste à réaliser l’analyse WGA au niveau de cultures tissulaires (plutôt que chez les patients) où l’on peut mesurer la réponse de chaque gène (plutôt que chaque maladie). On réalisera donc des milliers de WGA, une par gène, au moyen d’un groupe d’ordinateurs afin d’effectuer l’analyse en parallèle et donc d’accélérer le processus. En examinant chaque gène compris dans une biopuce, il sera possible d’identifier, sans biais, les gènes candidats et les polymorphismes nucléotidiques (ou SNP) qui semblent assurer la régulation de l’expression d’autres gènes importants en réponse au stimulus inflammatoire prototype. Ces gènes candidats et ces polymorphismes nucléotidiques seront alors mis à l’épreuve, lors de futures études, chez des sujets humains gravement malades.

Faculty Supervisor:

M. Mark Wilkinson

Student:

Rosalía Aguirre-Hernández

Partner:

Sirius Genomics Inc.

Discipline:

Medicine

Sector:

Life sciences

University:

University of British Columbia